Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CFAP100Q494V2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
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