Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SP6Q3SY56 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SP6Q3SY56 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms