Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
UVSSAQ2YD98 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UVSSAQ2YD98 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms