Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KNOP1Q1ED39 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms