Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GEN1Q17RS7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GEN1Q17RS7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms