Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DDR2Q16832 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms