Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ME3Q16798 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ME3Q16798 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ME3Q16798 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ME3Q16798 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ME3Q16798 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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