Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP2B3Q16720 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP2B3Q16720 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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