Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFE2Q16621 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NFE2Q16621 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms