Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ACKR1Q16570 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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