Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNAPC1Q16533 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNAPC1Q16533 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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