Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GABRA6Q16445 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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