Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1EQ15878 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CACNA1EQ15878 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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