Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ITSN1Q15811 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITSN1Q15811 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITSN1Q15811 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
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