Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TWIST1Q15672 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TWIST1Q15672 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms