Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP4Q15650 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP4Q15650 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms