Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRIP13Q15645 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIP13Q15645 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms