Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TAF1AQ15573 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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