Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RYR3Q15413 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
RYR3Q15413 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms