Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PDK3Q15120 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PDK3Q15120 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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