Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PDK1Q15118 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDK1Q15118 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms