Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD6Q15008 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSMD6Q15008 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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