Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSHL1Q14406 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms