Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IKBKEQ14164 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IKBKEQ14164 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms