Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDE6HQ13956 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PDE6HQ13956 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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