Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUL4BQ13620 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUL4BQ13620 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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