Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PEX6Q13608 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
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