Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXE3Q13461 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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FOXE3Q13461 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXE3Q13461 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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