Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PLD1Q13393 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms