Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF1Q13351 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF1Q13351 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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