Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3FQ13275 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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