Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGDRQ13258 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDRQ13258 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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