Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MKRN3Q13064 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MKRN3Q13064 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
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