Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
GRIN2AQ12879 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
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GRIN2AQ12879 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
GRIN2AQ12879 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GRIN2AQ12879 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
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