Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BPTFQ12830 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BPTFQ12830 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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