Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TROQ12816 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TROQ12816 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TROQ12816 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TROQ12816 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TROQ12816 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TROQ12816 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TROQ12816 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TROQ12816 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
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