Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNH2Q12809 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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KCNH2Q12809 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNH2Q12809 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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