Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TFCP2Q12800 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TFCP2Q12800 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms