Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TWF1Q12792 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms