Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 MUD2YKL074C 1584 nt2.32□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YDL068WYDL068W 330 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 FMP16YDR070C 282 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 CAJ1YER048C 1176 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RRF1YHR038W 693 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YJR157WYJR157W 363 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YML108WYML108W 318 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SIP18YMR175W 240 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 snR41snR41 95 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RGA1YOR127W 3024 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 UBR1YGR184C 5853 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SCH9YHR205W 2475 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YJL070CYJL070C 2667 nt2.31□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 GIS1YDR096W 2685 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YFR016CYFR016C 3702 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 NCE101YJL205C 162 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 IRC19YLL033W 693 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YLR255CYLR255C 354 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SEN15YMR059W 387 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 DGR1YNL130C-A 147 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RSA1YPL193W 1146 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YPL205CYPL205C 345 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 NCL1YBL024W 2055 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SCD5YOR329C 2619 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 APL5YPL195W 2799 nt2.3□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 NAN1YPL126W 2691 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 ECL1YGR146C 636 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YLR269CYLR269C 351 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RUF22RUF22 515 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 SLM6YBR266C 453 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 MPH1YIR002C 2982 nt2.29□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 ELG1YOR144C 2376 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YER188C-AYER188C-A 300 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 VAR1Q0140 1197 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 PSY1YKL076C 384 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 COX7YMR256C 183 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 YOR248WYOR248W 303 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 PHO91YNR013C 2685 nt2.28□□□□□ -2.04
SEC39Q12745 RNH70YGR276C 1662 nt2.28□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 IPT1YDR072C 1584 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 RAV1YJR033C 4074 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 SMC6YLR383W 3345 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 UFD4YKL010C 4452 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 MSL5YLR116W 1431 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 MZM1YDR493W 372 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 RPB5YBR154C 648 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 RRP6YOR001W 2202 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 SEC16YPL085W 6588 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YJL016WYJL016W 1686 nt2.27□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 TMN3YER113C 2121 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 BFA1YJR053W 1725 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YHR125WYHR125W 306 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YNL010WYNL010W 726 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 ROX1YPR065W 1107 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 TFC3YAL001C 3483 nt2.26□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 PPN1YDR452W 2025 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 HMLALPHA2YCL067C 633 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 MATALPHA2YCR039C 633 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YCL023CYCL023C 348 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 snR54snR54 86 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 PUT3YKL015W 2940 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 MSB1YOR188W 3414 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 VPS52YDR484W 1926 nt2.25□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 VOA1YGR106C 798 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 NOP10YHR072W-A 177 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 TEN1YLR010C 483 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 GRX8YLR364W 330 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YMR324CYMR324C 243 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 TSC3YBR058C-A 243 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YPR039WYPR039W 336 nt2.24□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 MGM1YOR211C 2646 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 ATG11YPR049C 3537 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YDL118WYDL118W 381 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 NBL1YHR199C-A 222 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 GIP3YPL137C 3831 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 IRC10YOL015W 1761 nt2.23□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 NEO1YIL048W 3456 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 CDC50YCR094W 1176 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YDL041WYDL041W 354 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 SMD1YGR074W 441 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 SNC1YAL030W 354 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YAR068WYAR068W 486 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 VTI1YMR197C 654 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 USO1YDL058W 5373 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 AGC1YPR021C 2709 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 IST2YBR086C 2841 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 TUS1YLR425W 3924 nt2.22□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 SSQ1YLR369W 1974 nt2.21□□□□□ -2.05
SEC39Q12745 YGR025WYGR025W 303 nt2.21□□□□□ -2.06
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