Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APOBRQ0VD83 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APOBRQ0VD83 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms