Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYCNQ0VAF6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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