Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM27E3Q08E93 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM27E3Q08E93 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms