Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
LRP1Q07954 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms