Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CXCL9Q07325 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CXCL9Q07325 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms