Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL16A1Q07092 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL16A1Q07092 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms