Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR3Q06889 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR3Q06889 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms