Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PAX8Q06710 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PAX8Q06710 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms