Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
RAD51Q06609 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms