Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALD1Q05682 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALD1Q05682 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms